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      活动时间:2020年3月份
      活动要求:
      1、三月份完成签单和送样;
      2、赠送试剂盒待项目结题后,由所在地区区域经理负责配送;
      3、文章发表时,需注明转录组测序分析及qPCR试剂盒由百迈客提供,见刊后提供全文。

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      案例分享

      英文题目:Global transcriptomic analysis of zebrafish in response to embryonic exposure to three antidepressants, amitriptyline, fluoxetine and mianserin

      中文题目:转录组分析斑马鱼胚胎暴露于三种抗抑郁药(阿米替林,氟西汀和米安色林)的应答机理

      发表杂志:Aquatic Toxicology

      影响因子:4.129

      合作单位:上海大学环境与化学工程学院

      研究背景

      人用和兽用药物是一种新兴的有机污染物,首次发现是在20世纪70年代的时候,在污水流出物中检测出。药物的生产和发展旨在治愈疾病、改善人类健康,但由于过量或过期药物的随意排放,同时废水处理厂(WWTPs)对大多数药物残留的去除较为低效,所以低浓度药物及其分解产物仍然广泛分布在水生系统中。

      抗抑郁药是全球治疗焦虑、恐慌症和抑郁症最常用的药物。它们也是水生环境中最常检测到的药物。已有研究表明,多种抗抑郁药物在水生环境及水生生物中积累,抗抑郁药物可能会影响水生生物的繁殖能力、生存、生长、捕食和学习行为,但是抗抑郁药物影响水生生物的作用机制仍然难以明确。

      作者为了更好地了解不同种类抗抑郁药诱导的毒性反应在非靶向鱼类中的作用机制,用分属于不同抗抑郁药物类别的阿米替林(Amitriptyline hydrochloride)、氟西?。‵luoxetine hydrochloride)和盐酸米安色林(mianserin hydrochloride)对早期发育阶段的斑马鱼胚胎进行处理,然后进行了转录组测序(RNA-Seq),基于前面转录组的分析结果,作者采取两组qPCR验证实验:

      1.?DEG表达模式验证

      作者根据RNA- seq结果选取了15个基因(4个上调、11个下调),用qPCR验证其表达模式。结果表明,qPCR结果与RNA-Seq结果相似(图3A~C)。此外,通过线性拟合和皮尔逊相关性方法分析了RNA-Seq和qPCR的结果间的相关性,结果表明两种方法的分析结果呈显著正相关(图3D~F)。

      2.不同浓度的抗抑郁药物处理下DEG的应答反应

      作者用三种不同浓度的抗抑郁药(0.1、1和10 μg /L)处理斑马鱼胚胎,应用qPCR试验确定6个选定的基因的浓度—应答关系。结果表明,ptgdsb的mRNA水平只在1 μg /L阿米替林和10 μg /L米安色林处理组显著降低;而dusp5表达水平在10 μg /L阿米替林和米安色林处理组以及所有氟西汀处理组中均显著降低;除了在1和10 μg /L阿米替林处理组中的nr1d1表达水平未受抑制之外,nr1d1和per2在几乎所有抗抑郁药物处理组均受到显著抑制。此外,两个与早期生长应答相关的基因egr1和egr4在0.1和10 μg /L阿米替林处理组和所有米安色林处理组中表达下调,egr4在所有氟西汀处理组降低,而egr1只在0.1和10 μg /L氟西汀处理组中表达降低(图4)。

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